Exercise 7. The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. Упражнение 7. Обучить классификатор последовательностей ДНК. Лабораторная работа на R

© Данная готовая работа выполнена сотрудником нашего сайта. Если Вы считаете, что эта страница каким-либо образом нарушает Ваши авторские права, то Вам следует обратиться в администрацию нашего сайта по адресу info@kursovik.com либо через форму обратной связи.

Если Вам нужны все файлы проекта данной программы на языке программирования R, заполните форму заказа, которая доступна по следующей ссылке.

Среда программирования: R

Название работы: Exercise 7. The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. Упражнение 7. Обучить классификатор последовательностей ДНК

Вид работы: Лабораторная работа

Тематика работы: Прочие

Объем программы: 4 (по десятибалльной шкале)

Уровень сложности: 7 (по десятибалльной шкале)

Разработчик (автор): Программист сайта kursovik.com (письмо автору)
Данная работа написана ЧЕЛОВЕКОМ без использования ИИ

Ключевые слова: Классификатор последовательностей ДНК, R-код, workspace sequences train, JKU Moodle, объект R, коэффициент длины, xTrain, объект DNAStringSet, последовательности длины, пакет Bioconductor kebabs, для обучения модели, предсказывает класс, гиперпараметры SVM, загрузите тест, R workspace, данные RData

Функции программы:

Обучить классификатор последовательностей ДНК. Упражнение 7.
Разработать программу на R в соответствии с заданием:

Упражнение 7.
Задача этого упражнения - обучить классификатор последовательностей ДНК. С этой целью загрузите программу R workspace sequences train.RData из JKU Moodle. Это рабочее пространство содержит два объекта R, которые следует использовать для классификации последовательностей:
yTrain: коэффициент длины 635.
xTrain: объект DNAStringSet, который содержит 635 последовательностей длиной 601.
Используйте пакет Bioconductor kebabs для обучения модели, которая предсказывает класс. Какое ядро и другие гиперпараметры SVM вы используете, зависит от вас. Однако вам следует попробовать по крайней мере пять различных ядер (включая также одно позиционно-зависимое ядро). Выполните перекрестную проверку, чтобы найти лучшее ядро и наилучшие параметры. Тщательно задокументируйте то, что вы сделали. Кроме того, загрузите тест последовательностей R workspace.Данные RData. Он содержит объект DNAStringSet xTest. Используйте свою модель, чтобы предсказать этикетку для этих 424 тестовых образцов. Кроме того, попробуйте получить некоторую интерпретацию для модели, которую вы обучили (например путем вычисления весов признаков и/или профилей прогнозирования).

Отправьте следующее:
1. Файл рабочей области R с числовым вектором yTest, который содержит прогнозы для 424 тестовых выборок (коэффициент со значениями, как в обучающем наборе).
2. Полный R-код, который вы использовали для выбора модели и для обучения конечных моделей.
3. Отчет, в котором освещается ваш подход и результаты, а также интерпретационная оценка результатов.
4. В качестве альтернативы пунктам 2. и 3.: если вы используете Sweave или knitr для написания своего отчета, вы можете объединить отчет и код в исходный файл Sweave/knitr. В этом случае вам не нужно отправлять код и отчет отдельно, но, пожалуйста, отправьте исходный файл и окончательный PDF-файл.
Конкурс по анализу данных: три модели с тремя наилучшими точностями классификации на основе тестовых данных получат по три дополнительных балла каждая.

Exercise 7.
The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. To this end, download the R workspace sequences train.RData from JKU Moodle. This workspace contains two R objects that should be used to classify sequences:
yTrain: factor of length 635.
xTrain: DNAStringSet object which contains 635 sequences of length 601.
Use the Bioconductor package kebabs to train a model that predicts the class. Which kernel and other SVM hyperparameter you use is up to you. However, you should try at least five different kernels (also include one position-dependent kernel). Perform cross validation to find the best kernel and the best parameters. Carefully document what you did. Furthermore, download the R workspace sequences test.RData. It contains a DNAStringSet object xTest. Use your model to predict the label for these 424 test samples. Furthermore, try to obtain some interpretation for the model you have trained (e.g. by computing feature weights and/or prediction profiles).
Submit the following:
1. An R workspace file with a numeric vector yTest that contains the predictions for the 424 test samples (factor with values like in the training set).
2. The complete R code that you used for model selection and for training the final models.
3. A report highlighting your approach and results along with an interpretative assessment of the results.
4. Alternatively to 2. and 3.: if you use Sweave or knitr to write your report, you can combine report and code into the Sweave/knitr source file. In that case, you need not submit code and report separately, but please submit the source file and the final PDF.
Data analysis contest: the three models with the best three classification accuracies on the test data will receive three points extra each.

2000 руб

+ 0 руб

76.70 Бел.руб

+ 0.00 Бел.руб

13200 тенге

+ 0.00 тенге

Купить

Задать вопрос менеджеру по продажам

Описание (отчет): Нет, но можно заказать его написание

Пояснения к компиляции и запуску программы:

Для работы с программой нужно использовать файл "exercise7.R", например, в R-Studio.

Статистика отдела программирования на заказ:
На данный момент (9 июня 2026) на выполнении находится 20 заказов.
Количество программистов, занятых выполнением текущих заказов: 7.
В текущем месяце (июнь 2026) нами уже выполнено 7 заказов.
В текущем году (2026) нами уже выполнено 207 заказов.
В прошлом году (2025) нами было выполнено 581 заказ.
В позапрошлом году (2024) нами было выполнено 762 заказа.
Количество активных программистов на сайте: 53.
Загруженность отдела заказами: 31%.

Результаты работы программы

1/8

Exercise 7. The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. Упражнение 7. Обучить классификатор последовательностей ДНК

2/8

3/8

Классификатор последовательностей ДНК, R-код, workspace sequences train, JKU Moodle, объект R, коэффициент длины, xTrain, объект DNAStringSet, последовательности длины,
пакет Bioconductor kebabs, для обучения модели, предсказывает класс, гиперпараметры SVM, загрузите тест, R workspace, данные RData

4/8

5/8

6/8

7/8

8/8

Заказать отчет

К данной программе НЕТ ОПИСАНИЯ (отчёта), но Вы можете заказать его написание (согласно Вашему оглавлению) автору данной программы. Чтобы узнать цену, нажмите на эту ссылку.

Купить исходный текст

Приобрести исходники программы за 2000 руб РФ . Купить

Вопрос автору

Посмотреть ответы на вопросы по данной готовой работе, задать свой вопрос автору.

Искать через Телеграм-БОТ

Поискать другую готовую работу с помощью нашего Телеграм-БОТа Перейти

Заявка на модификацию

Отправить заявку на модификацию данной работы под Ваше задание. Перейти

Список всего готовых работ на C#

Посмотреть список всего готовых работ на языке программирования C#. Перейти

Заказать новую работу

Отправить заявку на разработку уникальной программы согласно Вашему заданию Перейти

Файлы программы

Имя

Тип

Размер

Описание

исходники

<DIR>

Каталог

exercise7

2118

Оформление программы

К программе прилагается:

1) cловесное описание программы - 6 стр.

ВНИМАНИЕ ! Вы можете заказать написание отчета (согласно Вашему оглавлению) автору данной программы. Чтобы узнать цену, нажмите на эту ссылку.

Cловесное описание программы (1)

Отчет к программе. Содержание

Лабораторная работа
Exercise 7. The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. Упражнение 7. Обучить классификатор последовательностей ДНК

СОДЕРЖАНИЕ

Описание решения с результатами работы программы.

Предварительный просмотр

Стоимость готовой работы

Стоимость ИСХОДНОГО ТЕКСТА программы составляет 2000 руб РФ

Продажа каждой работы строго учитывается,
у каждой работы есть своя история продаж.

Заказ готовой работы

ФОРМА ЗАКАЗА
Для заказа готовой работы, заполните данную форму и нажмите кнопку ПРИОБРЕСТИ

Ваше имя:
Ваш E-mail:
(пожалуйста укажите реальный E-mail адрес) Просим Вас после заполнения данной формы проверить почту и найти наше письмо. Если письма в папке ВХОДЯЩИЕ не будет, пожалуйста проверьте папку СПАМ и, если письмо там найдётся, пометьте его как НЕ СПАМ, тем самым Вы поможете перестроить почтовую систему на правильный лад. Кроме этого, при заполнении данной формы, просим Вас указать больше контактов, например Ваш VK или мессенджер и мы продублируем наш ответ на Вашу заявку сообщением на Ваш дополнительный контакт, так будет надёжнее.
Ваш сотовый:	(желательно)
Ваш ВУЗ:	(аббревиатура)
Ваш город:
Ваша страна:

Вам нужен:	Исходный текст программы (исходники) = 2000 руб 76.70 Бел.руб 13200 тенге Cловесное описание программы = + 0 руб 0.00 Бел.руб 0.00 тенге Итого: 2000 руб 76.70 Бел.руб 13200 тенге

Введите код с картинки:

Я принимаю Пользовательское соглашение

При проведении оплаты с территории РФ платёж будет произведён через систему Ю.Касса, которая обеспечивает полную защиту онлайн-платежей при покупках в сети Интернет. Оплатить заказ можно как электронными деньгами, так и банковской картой, в том числе и по кредитной карте. Работает оплата через Сбер-Pay - оплата по QR-коду в приложении Сбербанк-Онлайн.
При проведении оплаты с территории РФ, файлы отправляются автоматически 24 часа 7 дней в неделю сразу после оплаты заказа.

При проведении оплаты не с территории РФ платёж будет зачислен в ручном режиме нашим администратором, для этого потребуется некоторое время.
При проведении оплаты не с территории РФ, файлы отправляются администратором с 10:00 МСК до 22:00 МСК 7 дней в неделю.

Приобретаемая Вами готовая работа является справочным материалом и НЕ является программным продуктом, либо товаром. Она продаётся КАК ЕСТЬ, поэтому обмену либо возврату НЕ подлежит. Подробности смотрите по следующей ссылке.

Вы можете связаться с нами по следующим контактам:

MAX:	max.ru/u/f9...JfZUts
Telegram:	Vitaly_work
ВКонтакте:	kursovikcom
WhatsApp:	+79033241149
Viber:	+79033241149
imo:	+79033241149
bip:	+79033241149
E-mail:	prog@kursovik.com

Если Вам необходимо модифицировать эту программу нажмите сюда
Если Вам необходимо написать работу "с чистого листа" на нужную Вам тему, нажмите сюда

Информация

ВНИМАНИЕ! Данная работа написана ЧЕЛОВЕКОМ без использования ИИ

Вопросы и ответы

Общие вопросы

Как можно приобрести данную готовую работу ?
- Заполните форму, которая расположена чуть Выше данного текста и нажмите кнопку "Приобрести"

Каким образом производится оплата ?
- После заполнения формы Вы получите на свой E-mail автоматическое письмо со всеми подробностями оплаты заказа. Оплата производится через платёжную систему Ю.Касса, которая обеспечивает полную защиту онлайн-платежей при покупках в Интернете. Оплатить заказ можно как электронными деньгами, так и банковской картой, в том числе и кредитной.

Как быстро я получу данную работу после ее оплаты ?
- В течение нескольких минут с момента оплата заказа. Мы работаем 7 дней в неделю.

Каким образом будет доставлена мне данная работа после оплаты ?
- На Ваш E-mail адрес и в личном кабинете нашего сайта sys.kursovik.com.

Какие Вы даете гарантии, что данная работа будет выслана мне после оплаты ?
- Смотрите рубрику Наши гарантии

Что включает в себя исходный текст программы ? Вы пришлете все файлы проекта ?
- Да, после оплаты Вы получите все файлы проекта данной работы, при желании сможете редактировать (видоизменять) программу (её описание) самостоятельно.

Зачем в форме заказа вы просите ввести мой ВУЗ и город ?
- Эти данные нам нужны для того, чтобы можно было предотвратить повторную продажу работы в один и тот же ВУЗ. На сайте в таблице продаж публикуется только информация о городах, куда была продана работа. Если клиент видит, что в его город работа уже покупалась, то он может запросить у нас название ВУЗов, куда покупалась эта работа. Данные о ВУЗе клиента хранятся только в нашей базе, в открытом доступе их нет. Если Вы все-таки не хотите оставлять информацию о городе и ВУЗе, то просто введите в соответствующие поля несколько пробелов. Тем не менее, мы Вам рекомендуем всё-таки указать достоверную информацию, тем самым Вы застрахуетесь от того, чтобы кто-то из студентов Вашего ВУЗа вместе с Вами сдавал одинаковую работу одному и тому же преподавателю.

На Вашем сайте указано что эта работа не может быть выдана за свою, почему так ?
- В идеале купленная работа должна быть использована в качестве образца или основы, чтобы студенту было проще написать свою собственную работу. Но если Вы всё-таки решите сдавать купленную у нас работу без изменений, то с нашей стороны по этому поводу никаких претензий не будет.

Действительно ли данная работа является уникальной ?
- Да, мы можем гарантировать уникальность данной работы.
  Она была разработана нашим программистом и выставлена на продажу в 2023 году.

Сколько раз была продана данная работа ?
- Ни разу.

Есть ли отчет (описание) к данной работе ?
- Готового нет, но Вы можете заказать его дополнительно. Для этого заполните пожалуйста форму, приведенную ниже. В форме укажите требуемое оглавление(план) отчета. Если в Вашем ВУЗе никаких особых требований к отчету не выдвигают, тогда выберите пункт "требований к отчету нет, всё на усмотрение программиста".
  Ваше оглавление для написания отчета к готовой программе «Exercise 7. The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. Упражнение 7. Обучить классификатор последовательностей ДНК / R»
  
  Ваше имя:
  Ваш город (где учитесь):
  Ваша страна:
  Ваша E-mail:
  
  Если никаких особых требований к отчету в Вашем ВУЗе не выдвигают, тогда выберите пункт:
  
  Требований к отчету нет, всё на усмотрение программиста
  
  Если у Вас есть методичка в электронном виде по выполнению данной работы, требования к отчету или любая другая информация, необходимая для написания отчета к программе, пожалуйста приложите ее к форме в виде архива ZIP или RAR, рисунка GIF или JPG, документа PDF. Приложить файл:
  
  Введите код с картинки:
  
  Я принимаю Пользовательское соглашение
  Чтобы отправить форму нажмите кнопку:

Рекомендуем Вам также посмотреть нашу рубрику "вопросы и ответы".

Задать вопрос по данной готовой работе

Если у Вас возник какой-либо вопрос по данной работе, пожалуйста заполните форму, приведенную ниже.
Ответ будет дан автором данной работы в обязательном порядке. Время отклика - 2-24 часа с момента заполнения формы. Если Ваш вопрос окажется полезным, мы разместим его на этой странице.

Телеграм-БОТ - помощь в поиске готовых работ по программированию

ВНИМАНИЕ! НОВИНКА!
Попробуйте наш Телеграм-БОТ для поиска готовых работ по программированию...

Программирование на заказ


*Имя:
*E-Mail:
Моб.телефон:
ВКонтакте:
Telegram:
Viber:
WhatsApp:
FaceBook:
Instagram:
	ВКонтакте Telegram Viber WhatsApp FaceBook Instagram

ВУЗ:
Специальность:
Город ВУЗа:
Страна:

*Введите код с картинки:
(сменить)
Я принимаю Пользовательское соглашение

Список всех готовых работ

Список всех готовых работ на C#

Программирование

Выборка готовой работы из рубрикатора

Экономика, право, психология, история

Электроника, Радиотехника, Механика

Программирование (по темам)

Ваше имя:
Ваш город (где учитесь):
Ваша страна:
Ваша E-mail:

Ваше имя:	*
Ваш город (где учитесь):	*
Ваша страна:	*
Ваш E-mail:	*
Ваш сотовый:	(если нужно продублировать ответ SMS-кой)

Логин
Пароль
	Запомнить меня

Лабораторная работа Exercise 7. The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. Упражнение 7. Обучить классификатор последовательностей ДНК в среде программирования R Программа

Лабораторная работа
Exercise 7. The task of this exercise is to train a DNA sequence classifier. Упражнение 7. Обучить классификатор последовательностей ДНК
в среде программирования R
Программа